Η Μονάδα Εσωτερικού Ελέγχου του Υπουργείου Παιδείας, Πολιτισμού, Αθλητισμού και Νεολαίας συστάθηκε και λειτουργεί από 23.4.2014, με βάση την Απόφαση του Υπουργικού Συμβουλίου Αρ. 75.481 και ημερομηνία 10.07.2013 (Μηχανισμοί Ελέγχου της Κρατικής Μηχανής).
Στις 12.12.2016, το Υπουργικό Συμβούλιο, με την Απόφαση του με Αρ. 81.770Β αναθεώρησε το πλαίσιο λειτουργίας των Μονάδων Ελέγχου σε όλα τα Υπουργεία μέσω της υιοθέτησης του «Μοντέλου των Τριών Γραμμών Άμυνας», όπου τοποθετεί τις Μονάδες Ελέγχου στη Δεύτερη Γραμμή Άμυνας. Σύμφωνα με τις πιο πάνω κατευθυντήριες γραμμές λειτουργίας της καθώς και με το άρθρο 80(2) του Νόμου που προνοεί περί της Δημοσιονομικής Ευθύνης και του Δημοσιονομικού Πλαισίου Ν.20(Ι)/2014, η Μονάδα Ελέγχου δεν υπάγεται ιεραρχικά σε κανένα άλλο Τμήμα ή Διεύθυνση του Υπουργείου αλλά αναφέρεται απευθείας στον οικείο Υπουργό.
Υπηρεσία Διαδικτύου και Επικοινωνίας - Υπουργείο Παιδείας, Αθλητισμού και Νεολαίας